Introducción: La infección de los pacientes ingresados adquiere cada día mayor relevancia. Las afecciones  respiratorias de causa infecciosa  ocupan un lugar importante dentro de este grupo. Objetivo: caracterizar los aislamientos bacterianos realizados en secreciones respiratorias de pacientes ingresados en el Hospital Universitario Clínico Quirúrgico Arnaldo Milián Castro de la Ciudad de Santa Clara de enero a diciembre de 2013 Metódica: Se realizó una investigación descriptiva transversal, la población estudio estuvo constituida por  410 cepas de microorganismos de origen bacteriano aislados a partir de secreciones respiratorias (lavado bronquial, secreciones, traqueotomía). Se reconsideraron todos los aislamientos independiente del origen de su infección (comunitaria o intrahospitalaria). Para obtener la  información se utilizó el  Libro de  Registros de Trabajo Diario  del Laboratorio de Bacteriología de la institución mediante una Guía de Revisión Documental, se definieron y operacionalizaron las diferentes variables de la investigación. Resultados: El 43.9 % de los aislamientos realizados fue de Acinetobacter spp seguido de Psudomonas aeruginosa (19.5).  El servicio  donde más aislamiento hubo  fue la terapia intensiva numero 1 con el 48.0%. Las cepas de Acinetobacter spp  mostraron  mas del 50.0 % de resistencia a los antimicrobianos probados. Conclusiones: Los microorganismos  mas aislados de secreciones respiratorias fueron  Acinetobacter spp y Psudomonas aeruginosa, el mayor numero de microorganismos se aisló en la sala de terapia intensiva I. Acinetobacter spp mostró los mayores niveles de resistencia antimicrobiana a todos los antimicrobianos probados,  Psudomonas aeruginosa  fue el microorganismo  mas sensible. Se realizaron recomendaciones.